Komisijai pavesta koordinuoti valstybės institucijų tyrimus, ar religinių, ezoterinių ar dvasinių grupių veikla atitinka įstatymus, užtikrinti keitimąsi informacija tarp suinteresuotų valstybės institucijų, teikti joms pasiūlymus dėl neatidėliotinų veiksmų, susijusių su religinių, ezoterinių ar dvasinių grupių veikla. Informaciją apie savo veiklą komisija kasmet iki vasario 15 d. teikia Lietuvos Respublikos Seimo Žmogaus teisių komitetui.

Komisijos sudėtyje esantys Teisingumo ministerijos atstovai:

Tomas Vaitkevičius – teisingumo viceministras (komisijos pirmininkas);
Donatas Glodenis – Teisingumo ministerijos Registrų departamento Juridinių asmenų ir religijų reikalų skyriaus vyriausiasis specialistas.